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而作为一种与靶向药物相关联的体外诊断技术,伴随诊断则主要通过检测人体内蛋白、突变基因的表达水平,在不同类型的疾病人群中筛选出最佳用药人群,有针对性地进行个体化医疗。

然而,其中只有约20%的人会出现非酒精性脂肪性肝炎,并在肝脏上留下疤痕。但不幸的是,另一些研究发现生活习惯并非一朝一夕能够改变。

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百花齐放的新药研发我不认为有哪一个重磅药物能治疗所有的患者,圣路易斯大学肝脏中心的Brent Tetri教授说道。无论是FXR激动剂也好,有其他新机理的新药也好,我们期待这些它们能够早日上市,造福这些目前尚无药可用的患者。其他公司也同样在拓展自己的研发管线。这些数据最早将于2019年公布。在这项当时规模最大的试验里,45%的患者在使用贝奥胆酸后,脂肪肝指数得到了改善。

目前,贝奥胆酸正处于一项大型的3期临床试验中。▲贝奥胆酸是鹅去氧胆酸类似物(图片来源:CEN)这款在临床阶段取得良好效果的新药是一种鹅去氧胆酸(chenodeoxycholic acid)的类似物,能够结合法尼酯X受体(FXR),并起到激动剂的效果。默沙东的已上市重磅免疫疗法产品KEYTRUDA是一种人源化的单克隆抗体,通过增加机体免疫系统的能力来帮助检测和对抗肿瘤细胞。

KEYTRUDA的临床开发计划包括了涉及30多种肿瘤类型的360多个临床试验,其中近200项试验是KEYTRUDA与其他癌症治疗方案的结合使用。随着更多癌细胞进展增殖,它们可形成肿瘤并扩散到身体的其他区域。▲KEYTRUDA的作用机理(图片来源:KEYTRUDA官网)KEYNOTE-045是一项随机、关键性的3期研究,评估了KEYTRUDA单一治疗与研究者选择的化疗方案(紫杉醇、多西紫杉醇、长春氟宁)的疗效比较,用于治疗转移性、局部晚期、或经铂类化疗后复发或进展的不可切除尿路上皮癌。次要终点是总体反应率(ORR)、反应持续时间(DOR)和安全性。

在目前被批准的适应症中,KEYTRUDA以每三周30分钟的静脉内输注形式给药。KEYTRUDA在这项试验的安全性与以前报告了的涉及晚期尿路上皮癌患者研究的观察结果一致。

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在这项试验中,KEYTRUDA比化疗疗效更优。临床试验提前终止 2016-10-24 07:00 · angus 日前,生物制药公司默沙东宣布,在其KEYNOTE-045 3期临床试验研究中,使用KEYTRUDA(pembrolizumab)治疗经治晚期尿路上皮癌患者时达到了总生存(OS)的主要终点。▲膀胱癌源于膀胱细胞开始不受控制地生长(图片来源:NIH)膀胱癌源于膀胱细胞开始不受控制地生长当前,大多数的知情同意表都被设计得尽可能简略,而不是以让研究人员更容易获得高质量数据为目的。

尽管公共领域和私有领域在现代化现有数据网络和保障其安全性上投入了数十亿美元,但信息泄露事件还是时有发生。他们将其称作复原力项目(Resilience Project),研究人员着手寻找那些携带那些疾病的DNA变体,但因为某种预防注射而没有患病的人。虽然这些公司相互间将竞争收集更多的优质生物数据,但Sema4将会向全球各地的学术性医疗中心和不以盈利为目的的研究者免费开放其基因数据库,由此实现差异化。在寻找这种有复原力的人的过程中,斯凯德及其团队利用收集自多个来源(包括23andMe、北京基因组研究所和麻省理工学院和哈佛大学共建的博德研究所)的数据积聚了一个涵盖60万人的基因数据池。

这些数据集越庞大,疾病模型和预测工具就会越精确,越强大。随着分析工具组合因为计算机和机器学习算法变得愈发强大而得到强化,科学家们将终于得到足够的基因数据来进行雄心勃勃的研究。

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(这也有助于科学家对病患的健康状况进行长期的跟踪。药品公司将需要付费使用该系统来寻找病患进行临床试验。

以复原力项目为例,其问题并不只是数据样本太小——还包括60万份基因组数据基于不同的知会同意安排来管理的问题。数据集越庞大,疾病模型和预测工具就会越精确,越强大。那种增长将会通过收购和扩张全球各地的基因检测公司来实现,它们大多数都相互独立运营,但都归属于Sema4。为了探索其复杂性模型,斯凯德带着投资家兼慈善家卡尔·伊坎(Carl Icahn)提供的资金来到西奈山医院,在地下室打造了一台名为Minerva的超级计算机,以便分析西奈山医院每年收集的数千组基因组数据。斯凯德当时刚刚在西奈山医院创立伊坎基因组学与多层级生物学研究所。他一直坐在她的病床旁陪着她,内心感到很悲痛。

正当不少研究人员作出基于疾病与药品开发单一基因模式的假定,他则认为基因并不是单独发挥作用,而是在广泛的网络中促使疾病渗入我们身体的自然防御系统,我们可能只能够通过深入的生物信息探索来理解那些网络。2014年,伊坎基因组学与多层级生物学研究所联手Sage Bionetworks创立了一家合资公司,尝试治疗170种罕见的儿童疾病,比如囊包性纤维症、镰状细胞性贫血和 家族黑蒙性痴呆。

任何的疾病,甚至包括晚期癌症,未来都有可能变得可以用药物控制。未来设想斯凯德对于未来的设想是:随着这种数字基础设施的落位,越来越多的病患将不仅仅共享他们的基因组数据,还共享通过像血糖仪、血压追踪器和吸入器这样的监测设备收集得到的医疗和生活方式方面的信息。

正是这一想法促使斯凯德2011年在为默克公司(Merck)开发药品十年后创立伊坎基因组学与多层级生物学研究所。她患上的是严重的结肠癌,癌细胞很快就转移到了她的肝脏。

他说,最终,我们都将知道所有的这些细胞和扰动究竟是怎么一回事。该位于纽约的合资公司将专注于收购和扩张致力于基因检测(如癌症患者筛选和非侵入性产前测试)的公司,以收集和共享数百万计的个人数据集。它们将会共同按照统一的安全和知会同意标准来创建巨大的基因信息网络。这种方式实际上加大了获得价值数据的难度。

规模化问题尽管有好几家科技巨头在涉足生命科学领域,美国国立卫生研究院也在请求100万位志愿者帮助创建自有的大型生物数据库,但斯凯德认为,Sema4以及其它像它那样的创业公司(如克雷格·文特尔的Human Longevity和Patrick Soon-Shiong的Nant-Health)在实现基因数据的最优规模上是最专注的。它们并没有被编入一个可带来我们在几乎所有其它的行业都可以看到的那种进步的连贯的框架。

它们之间太过疏远,竞争太大。目前研究人员还无法获得那种量级的数据。

但实际上,获取海量数据存在两大难题:规模化和知情同意。但在寻找那60万个数据组时,研究人员发现有些人仅对他们针对的170种疾病中的8种有复原力。

知情同意问题另外还有知情同意问题——病患对于数据收集的详细理解和批准。那是没有大数据和机器学习的年代,又或者说是毫无希望的年代。通过计算引发疾病的基因突变在人口中的发生频率,斯凯德及其团队意识到,他们需要的样本数量并不是60万,而是1000万以上。)在Sema4,斯凯德采用多阶段的信息获取流程(其中包括强制性的小测验),进而让病患能够全面了解他们所同意的事项。

此外,那些数据通常都不包括DNA数据或者基于DNA数据生成的基因组数据。你必须要先说服他们你只将那些数据用于正当的用途,不会令其落入不当之人手中。

斯凯德说,在Sema4,我们的目标是将每年收集到的样本数量扩大到50万。但通过其在西奈山医院的新实验室,他会生成1TB有关该妇女的癌症的数据,寄望于找到新方法来帮助她对抗癌症。

成立合资公司斯凯德没多久便发现自己需要一个更大的组织。但斯凯德认为,那并不足以深入探索个人的DNA。

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